Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms