Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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