Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gins3Q9CY94 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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