Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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