Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms