Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CWU4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CWU4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms