Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms