Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pard3bQ9CSB4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pard3bQ9CSB4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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