Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms