Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PompQ9CQT5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PompQ9CQT5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
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PompQ9CQT5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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PompQ9CQT5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PompQ9CQT5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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