Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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