Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms