Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rims1Q99NE5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms