Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprtQ99M80 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprtQ99M80 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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