Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp5lQ99LH9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh3bp5lQ99LH9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms