Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms