Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms