Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
EpcamQ99JW5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
EpcamQ99JW5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms