Protein–RNA interactions for Protein: Q99J64

Rbm43, RNA-binding protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm43Q99J64 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms