Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms