Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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