Protein–RNA interactions for Protein: Q91YT2

Rnf185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf185Q91YT2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf185Q91YT2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms