Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atl3Q91YH5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms