Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usb1Q91W78 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usb1Q91W78 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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