Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hps3Q91VB4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms