Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

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Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt79Q8VED5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt79Q8VED5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt79Q8VED5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt79Q8VED5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt79Q8VED5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt79Q8VED5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt79Q8VED5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt79Q8VED5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt79Q8VED5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Krt79Q8VED5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt79Q8VED5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt79Q8VED5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Krt79Q8VED5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt79Q8VED5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt79Q8VED5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt79Q8VED5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt79Q8VED5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Krt79Q8VED5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt79Q8VED5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt79Q8VED5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt79Q8VED5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Krt79Q8VED5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt79Q8VED5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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