Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms