Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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