Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms