Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops8Q8VBV7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms