Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssh3Q8K330 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms