Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sde2Q8K1J5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sde2Q8K1J5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms