Protein–RNA interactions for Protein: Q8K119

Pms1, PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms1Q8K119 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms