Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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FgbQ8K0E8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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