Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms