Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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SbsnQ8CIT9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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SbsnQ8CIT9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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SbsnQ8CIT9 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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SbsnQ8CIT9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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SbsnQ8CIT9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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