Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI19

Pdgfc, Platelet-derived growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfcQ8CI19 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfcQ8CI19 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms