Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Hpf1Q8CFE2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Hpf1Q8CFE2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Hpf1Q8CFE2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Hpf1Q8CFE2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Hpf1Q8CFE2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Hpf1Q8CFE2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Hpf1Q8CFE2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hpf1Q8CFE2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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