Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms