Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc63Q8CDV6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms