Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ccdc38Q8CDN8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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