Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Nhlrc3Q8CCH2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Nhlrc3Q8CCH2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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