Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Snx16Q8C080 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Snx16Q8C080 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Snx16Q8C080 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Snx16Q8C080 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx16Q8C080 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx16Q8C080 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx16Q8C080 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx16Q8C080 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx16Q8C080 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx16Q8C080 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx16Q8C080 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms