Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrtm1Q8BXQ3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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