Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PcgF3Q8BTQ0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms