Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyp4f39Q8BGU0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms