Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpped1Q8BFS6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms