Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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H2-M10.6Q85ZW5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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H2-M10.6Q85ZW5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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H2-M10.6Q85ZW5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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H2-M10.6Q85ZW5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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H2-M10.6Q85ZW5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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H2-M10.6Q85ZW5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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H2-M10.6Q85ZW5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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H2-M10.6Q85ZW5 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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H2-M10.6Q85ZW5 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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