Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ccdc172Q810N9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms