Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cracr2bQ80ZJ8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms